Произходът на манастира може да се проследи до 10 век. Обстоятелствата около неговото основаване са противоречиви. Според едни източници първоначално манастирът е основан близо до пристанището Дафни в края на 10 век от Ефтимий, възпитаник на Свети Атанасий Атонски и домакин (на гръцки δοχειάρης, дохиарис) на манастира Велика Лавра. Според други източници манастирът е основан от монаха Даниел от Дохияр между 1030-1032 година.

Скоро след основаването си манастирът запада, вероятно от честите пиратски набези, по време на франкската окупация на Атон и след завладяването на Константинопол от латините през 1204 година. Оцелелите монаси започват изграждането на настоящия манастир. През 14 век Дохияр получава помощ от император Йоан V Палеолог и сръбския крал Стефан Душан. Главната църква (католикон) на манастира е построена в средата на 16 век с финансовата помощ на Александър и Роксандра от Молдова и Йоан Лапуснеанос. По време на отоманската окупация на Атон по време на войната за гръцка независимост през 1821 година, Дохияр губи почти цялото си имущество.

Главната църква, построена върху основите на по-стар храм, е посветена на архангелите Михаил и Гавраил. Празникът на манастира е на 8 ноември. Стените на църквата са изографисани от майстор Георги от Крит през 1568 година и от друг майстор през 1783 година. Трапезарията е изографисана през 1675 година. В манастира има 10 параклиса.