Средновековната църква "Свети Йоан Кръстител" се намира в централната част на Стария Несебър.
Тя е трикорабна и има четири зидани стълба, поддържащи целия купол. Има правоъгълен план с размери 12 x 10 м. Градена е от ломен камък и хоросан.
Църквата е типичен представител на прехода от скъсената базилика към кръстокуполната църква.
Над центъра – на вписан кръг, се извисява цилиндричен барабан, завършващ с полусферичен купол. На изток завършва с три полукръгли апсиди. Църквата е без притвор. Западната, северната и южната фасада са насочени с по една висока сляпа арка.
Църквата е измазана и стенописана. От изображенията са запазени ктиторски портрет (XIV в.), разположен на южната стена, както и сцена с образа на Св. Марина (XVII в.), разположена върху югозападната колона.
Днес църквата не функционира, включена е в бъдещ проект на община Несебър за опазване на културните и архитектурни паметници в „Старинен Несебър”. Авторите на проекта предлагат да се създаде и да се разработи един културен - „Духовен път”, който да включва и останалите средновековни църкви в града.